Трепан-биопсия — вид биопсии, при котором применяются специальные иглы, имеющие резьбу. Данные иглы ввинчиваются в исследуемые ткани, а после резко вынимаются. В итоге на режущей кромке резьбы задерживаются частицы ткани, намного большие по размеру чем при стандартной пункционной биопсии. На сегодняшний день разработаны варианты так называемых пистолетов для проведения трепан-биопсии, позволивших оптимально облегчить проведение данного вида биопсии как для врача, так и для пациента.